Madoka é uma garota comum que um dia teve um sonho estranho… ela viu uma garota lutando sozinha contra algo imenso, algo que claramente ela não poderia derrotar por si só. Para sua surpresa essa mesma garota é a nova aluna de sua classe, a misteriosa Homura Akemi. No mesmo dia, passeando com sua amiga Sayaka Miki, encontram Akemi perseguindo uma pequena e fofa criatura chamada Kyubey. Eles salvam a coisinha das mãos de Homura e então ficam sabendo que existem criaturas malignas no mundo chamadas Bruxas e para combatê-las existem as Garotas Mágicas. Inspiradas por uma Garota Mágica que acabam conhecendo (sendo salvas por ela) elas veem o lado heroico da coisa toda e Kyubey diz que elas também podem se transformar em Garotas Mágicas, basta fazer um pedido, qualquer um… mas ser uma Garota Mágica também têm o lado ruim…

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Aqui serão postados os spin-offs criados pelo Magica Quartet. A maioria são histórias que se passam em universos paralelos e enriquecem ainda mais a franquia.